结构域
结构域（structuraldomain）是介于二级和三级结构之间的另一种结构层次。对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链往往由两个或多个在空间上可明显区分的、相对独立的区域性结构缔合而成三级结构，这种相对独立的区域性结构就称为结构域。不同蛋白质分子中结构域的数目不同，同一蛋白质分子中的几个结构域彼此相似或很不相同。
蛋白质的三级结构
一条多肽链具有三维的立体结构的球状蛋白质。但是像胰岛素和r-球蛋白那样的，即使是由许多条肽链组成，但在其链间有象S－S键那样的共价键，这些链的集合体为三维立体结构，称为三级结构。其中包括上述的双硫键，酪氨酸和羧基之间的氢键，但起最重要作用的是疏水键。