5 分類類型
屬
7 甲病毒屬成員
| 種 | 型 |
| 奧拉病毒(Aura virus) | |
| 巴馬森林病毒(Barmah Forest virus) | |
| 比巴魯病毒(Bebaru virus) | |
| 卡巴斯歐病毒(Cabassou virus) | |
| 基孔肯雅病毒(Chikungunya virus) | |
| 東方馬腦炎病毒(Eastern equine encephalitis virus) | |
| 沼澤地病毒(Everglades virus) | |
| 摩根堡病毒(Fort Morgan virus) | 博吉河病毒(Buggy Creek virus) |
| 蓋塔病毒(Getah virus) | |
| 高地J病毒(Highlands J virus) | |
| 馬亞羅病毒(Mayaro virus) | |
| 米德爾堡病毒 (Middelburg virus) | |
| 莫斯達斯佩德拉斯病毒(Mosso das Pedras virus) | |
| 穆坎布病毒 (Mucambo virus) | |
| 恩杜穆病毒(Ndumu virus) | |
| 歐尼恩病毒(O’nyong-nyong virus) | |
| 那皮舒納病毒(Pixuna virus) | |
| 里奧內格羅病毒(Rio Negro virus) | 里奧內格羅病毒Ag80-663株(Rio Negro virus-Ag80-663) |
| 羅斯河病毒(Ross River virus) | |
| 鮭魚胰腺病病毒(Salmon pancreas disease virus) | 嗜睡症病毒(Sleeping disease virus) |
| 西門利啓森林病毒(Semliki Forest virus) | |
| 辛德比斯病毒(Sindbis virus) | 巴班肯病毒(Babanki) |
| 孜拉加奇病毒(Kyzylagach) | |
| 奧克爾布病毒(Ockelbo) | |
| 南方象海豹病毒(Southern elephant seal virus) | |
| 圖那特病毒(Tonate virus) | |
| 特羅卡拉病毒(Trocara virus) | |
| 烏納病毒(Una virus) | |
| 委內瑞拉馬腦炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus) | |
| 西方馬腦炎病毒(Western equine encephalitis virus) | |
| 瓦塔羅阿病毒(Whataroa virus) | |
8 甲病毒屬基本特性
甲病毒屬成員基因組長度爲11-12kb,基因組5’端有m7G通過5’-5’三磷酸與A相連,在A上缺少核糖甲基化,因此甲病毒5’端爲O型帽子結構。病毒基因組3’端帶有poly(A)尾,但比真核生物mRNA的3’端poly(A)尾短,平均長度70bp。甲病毒RNA的感染性需要3’端poly(A)尾的存在,,一些病毒基因組缺少poly(A)尾則沒有感染性。
甲病毒基因組(49S RNA)既可作爲mRNA翻譯合成非結構蛋白(nsPs),也可作爲複製的模板合成負鏈RNA,負鏈RNA又是新的病毒基因組和26S亞基因組RNA合成的模板。病毒基因組RNA的翻譯從靠近其5’端的單一AUG起始,一直延伸到病毒基因組2/3處的3個終止密碼子,3個終止密碼子恰好在亞基因組轉錄起始點的下游。合成的多聚蛋白經過翻譯後切割,生成4種特定的多肽,分別稱爲nsP1、nsP2、nsP3和nsP4,其中nsP2的C端有蛋白酶活性,N端與細菌解旋酶同源;nsP1具有甲基轉移酶活性,與負鏈RNA合成有關;nsP4是一種病毒聚合酶,含有許多病毒RNA聚合酶所共有的GDD基序。