由于真菌性角膜炎主要见于有植物性外伤史的患者，因此务农人员在生产作业时应特别注意，要避免眼睛被农作物、果树等植物损伤。
对于佩戴隐形眼镜的人，要掌握正确的使用方法，如隐形眼镜在浸入多动能液中过夜之前，必须用手指揉搓，并彻底冲洗；抛弃型隐形眼镜只能在建议的使用期内使用，严禁超期使用；即使眼镜没有每日佩戴，用于保存抛弃型隐形眼镜的多功能护理液仍必须每日更换；隐形眼镜盒应当至少每三个月更换一次。如果使用者出现眼睛发红、视力模糊及眼部疼痛，均需马上停止佩戴隐形眼镜，并且咨询隐形眼镜从业人员或者眼科医生。
此外，还应避免全身或眼睛局部长期滥用抗生素或皮质类固醇激素。
